The Legend of Zelda: Breath of the Wild erzählt die Geschichte von Link, der versucht, einen bereits zerstörten Hyrule zu retten. Zu Beginn des Spiels erwacht Link im Schrein der Auferstehung, der von Prinzessin Zelda zum Handeln gerufen wird, um aufzutauchen und sich Calamity Ganon zu stellen, einer mächtigen Version von Ganon, die bei seiner Eroberung von Hyrule erfolgreich war. Wann Atem der Wildnis beginnt, hat Link alle seine Erinnerungen verloren und ist sich nicht sicher, wie lange er in der Stasis war.
Als Link den Schrein der Auferstehung verlässt und alle vier Mächte des Sheikah Slate aktiviert, sagt ihm der Geist von König Rhoam Bosphoramus Hyrule auf dem Tempel der Zeit, dass die Zerstörung von Hyrule vor 100 Jahren stattgefunden hat und Zelda hat Calamity Ganon davon abgehalten seitdem im Schloss Hyrule. Link war Zeldas persönlicher Beschützer und wurde bei dem Versuch, sie zu beschützen, schwer verletzt. Er wurde als letztes Mittel zum Schrein der Auferstehung gebracht, damit er eines Tages auftauchen und versuchen würde, Hyrule zurückzuerobern.
Obwohl es in ganz Hyrule ein paar kleine Siedlungen gibt, wurde die große Mehrheit von Monstern überrannt. Ruinen sind überall und die vollständige Zerstörung von Castle Town zeigt, wie gründlich Calamity Ganon bei seinem Angriff war. Obwohl die Zerstörung von Hyrule vor 100 Jahren stattgefunden hat, gibt es in Hyrule immer noch andere Menschen als Link, die zu dieser Zeit am Leben waren.
Links Schlaf im Schrein der Auferstehung ist ein Sonderfall. Unzählige Einwohner von Hyrule starben in der zweiten großen Katastrophe, und kleine Dörfer haben es im letzten Jahrhundert geschafft, zu überleben, aber ein paar Menschen haben es geschafft, durch Hyrules Zerstörung am Leben zu bleiben. Der erste Link, dem er begegnet, ist normalerweise ein älterer Impa, ein wiederkehrender Charakter im ganzen Legende von Zelda Serie. Ein spielbarer Charakter in Zeitalter der Katastrophe, Impa präsidiert jetzt im hohen Alter von etwa 120 Jahren das Dorf Kakariko. Impas ältere Schwester Purah lebt ebenfalls noch, obwohl ein Experiment ihren Alterungsprozess umgekehrt hat und Link als kleines Kind erscheint.
Die einzige andere Person, die das letzte Jahrhundert überlebt hat, ist Prinzessin Zelda, die irgendwie ungealtert bleibt, während sie Calamity Ganon in Hyrule Castle festhält. Wie sie in den letzten 100 Jahren unverändert geblieben ist, wird nie beschrieben in Atem der Wildnis, aber es hat vermutlich etwas mit der Magie zu tun, mit der sie sich und Ganon auf das Schloss beschränkt hat. Zeldas fleißige Arbeit im letzten Jahrhundert sicherte höchstwahrscheinlich das Überleben derer, die im verwüsteten Hyrule verstreut leben.