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Erster Minister Nicola Sturgeon sagte, dass jeder Schritt, den Besuchern von England nach Schottland Beschränkungen aufzuerlegen, auf dem Risiko und nicht auf der Politik beruhen würde.
In der Andrew Marr Show sagte sie, dass eine Quarantäne für Besucher aus anderen Teilen Großbritanniens nicht ausgeschlossen werden könne.
Premierminister Boris Johnson hat die Idee zuvor als "erstaunlich und beschämend" bezeichnet.
Schottland verzeichnete eine geringere Rate an Covid-Infektionen als England.
Der erste Minister sagte, die britischen Nationen müssten beim Ausbruchsmanagement so zusammenarbeiten, dass "keine Grenzbeschränkungen eingeführt werden müssen".
Frau Sturgeon sagte gegenüber Andrew Marr: "Eines unserer größten Risiken in den nächsten Wochen, da wir die Viruskonzentration in Schottland auf ein sehr niedriges Niveau gebracht haben, ist das Risiko der Einfuhr in das Land.
"Deshalb haben wir eine sehr vorsichtige Entscheidung bezüglich der internationalen Quarantäne getroffen.
"Und – das ist keine Position, in der ich mich gerne befinde – es bedeutet auch, dass wir uns genau ansehen müssen, um sicherzustellen, dass das Virus nicht aus anderen Teilen Großbritanniens kommt."
Der erste Minister wies darauf hin, dass in Ländern wie Australien und den Vereinigten Staaten Kontrollen eingeführt wurden, um die Bewegung über Staats- oder Regionalgrenzen hinweg zu begrenzen.
Die schottische Regierung würde ähnliche Maßnahmen auf der Grundlage der öffentlichen Gesundheit prüfen.
Frau Sturgeon sagte: "Das ist nicht politisch. Es ist nicht konstitutionell. Es vertritt nur eine ähnliche Ansicht wie Länder auf der ganzen Welt, um die Bevölkerung vor dem Risiko des Virus zu schützen."
"Hier geht es nicht darum, Menschen in England zu sagen, dass Sie in Schottland nicht willkommen sind – natürlich sind Menschen in England in Schottland willkommen", fügte sie hinzu.
'Keine Grenze'
Das Thema Quarantäne für Besucher aus England, die nach Schottland einreisen, wurde auf Fragen des Premierministers angesprochen. Herr Johnson beschrieb die Idee als "erstaunlich und beschämend".
Er fügte hinzu: "Es gab keine derartigen Diskussionen mit der schottischen Regierung darüber, aber ich möchte darauf hinweisen, dass es keine Grenze zwischen England und Schottland gibt."
Die Zahl der neuen Coronavirus-Fälle in Schottland ging am Samstag auf einzelne Zahlen zurück, nachdem ein Anstieg am Freitag Frau Sturgeon veranlasst hatte, vor Selbstzufriedenheit zu warnen.
Am Samstag wurden keine Covid-19-Todesfälle gemeldet. Damit war es der dritte Tag in Folge ohne neue Todesfälle.