Vlhova schaltete den zweiten ihrer beiden Läufe für eine kombinierte Zeit von 1 Minute und 59,05 Sekunden unter Flutlicht aus und verdrängte die zweitplatzierte Katharina Liensberger aus Österreich nur um fünf Hundertstelsekunden.
Die Schweizerin Michelle Gisin, die letzte Woche in Semmering ihren ersten Slalom-Weltcup-Sieg feierte, komplettierte das Podium der Veranstaltung am Sonntag.
Shiffrin, die erst kürzlich nach dem unerwarteten Tod ihres Vaters Jeff im vergangenen Jahr auf die Rennstrecke zurückgekehrt ist, suchte ihren fünften Sieg am legendären Veranstaltungsort außerhalb der kroatischen Hauptstadt, kam aber nur knapp heraus.
Ein guter zweiter Lauf weckte die Hoffnungen der Amerikanerin, aber zuerst Gisin, dann die anderen Podiumsplatzierten kamen voran und ließen sie 0,27 Sekunden hinter dem Tempo zurück.
Vlhova hat mit ihrem elften Karrieresieg ihre Führung in der Gesamtweltcup- und Einzel-Slalom-Wertung gefestigt, räumte jedoch ein, dass es im zweiten Lauf eine schwierige Sache mit schwierigen Bedingungen für die späteren Starter gewesen war.
"Heute war ein sehr harter Tag und insbesondere die zweite Runde, aber ich habe etwas gefunden und vor dem Ziel mehr Druck gemacht", sagte sie gegenüber Eurosport.
"Als ich sah, dass ich im zweiten Lauf nur der elftschnellste war, dachte ich, ich wäre sicher nicht auf dem Podium, aber dann zeigte sich grünes Licht und ich konnte es nicht glauben."
Die dreifache Weltcup-Gesamtsiegerin Shiffrin hat sich seit ihrer Rückkehr auf ihre bevorzugten technischen Ereignisse konzentriert und im vergangenen Monat ihren 67. Sieg im Courchevel-Riesenslalom errungen.
Das Rennen am Sonntag war ihr sechstes im Slalom ohne Sieg, aber sie bestand darauf, dass "die Dinge in eine gute Richtung gehen", nur in ihrem sechsten Rennen nach ihrer längeren Pause.
Shiffrin gewann bei den letzten Weltmeisterschaften im Jahr 2019 zwei Goldmedaillen, muss sich jedoch noch entscheiden, ob sie ihre Super-G-Krone bei den Meisterschaften im nächsten Monat in Cortina, Italien, verteidigen soll, da sie bei den Geschwindigkeitsereignissen nur wenig spezielles Training absolviert hat.
Aber mit den drei Podestplatzierten in Zagreb in guter Form und der Rückkehr von Shiffrin zu ihrem Besten ist die Bühne für einen königlichen Kampf um Medaillen im Slalom und Riesenslalomrennen bei den Meisterschaften bereit.