Dinamo überwand ein 2: 0-Defizit aus dem Hinspiel und gewann nach Verlängerung am Donnerstag dank des Hattricks von Mislav Orsic mit 3: 2.
Dies bedeutet, dass der kroatische Meister das Viertelfinale der Europa League erreicht, während Tottenham, derzeit Achter in der Premier League, sich fragen muss, wie die Saison der Mannschaft von hier aus weitergeht. Der Gewinn der Europa League hätte es Spurs ermöglicht, in der nächsten Saison in der Champions League zu spielen.
"Meine Mannschaft sah nicht so aus, als würde sie ein wichtiges Spiel spielen", sagte Mourinho nach dem Spiel gegenüber BT Sport.
"Wenn es für einen von ihnen kein wichtiges Spiel ist, ist es für mich auch. Für den Respekt, den ich für meine eigene Karriere und für meinen eigenen Job habe, ist jedes Spiel ein wichtiges Spiel für mich.
"Und ich glaube, dass für jeden Tottenham-Fan zu Hause jedes Spiel wichtig ist. Eine andere Einstellung ist erforderlich. Zu sagen, dass ich traurig bin, reicht nicht aus, weil das, was ich fühle, viel weiter geht als Traurigkeit."
Orsic erzielte kurz nach der vollen Stunde das erste Tor seiner Mannschaft – ein sensationeller Curling-Schuss von außerhalb des Strafraums – und fügte 20 Minuten später eine Sekunde hinzu, als er eine Flanke von Ersatzspieler Iyayi Atiemwen ablieferte.
Mit dem Spiel in der Verlängerung beendete Orsic seinen Hattrick mit einem mazy Run an einer Reihe von Tottenham-Spielern vorbei, bevor er an einem tauchenden Lloris vorbeikam.
Noch bemerkenswerter an dem Ergebnis ist, dass Dinamo vor dem Spiel am Donnerstag in Unordnung geriet, nachdem Manager Zoran Mamic wenige Tage zuvor zurückgetreten war.
"Wir sind alle mehr als enttäuscht. Es ist nur eine Schande", sagte Lloris nach dem Ausscheiden von Tottenham aus der Europa League gegenüber BT Sport.
"Ich hoffe nur, dass sich alle in der Umkleidekabine für die Situation verantwortlich fühlen, weil es eine Schande ist. Was kann ich jetzt noch dazu sagen … Der Geschmack der Niederlage heute Abend ist mehr als schmerzhaft."
Während Dominik Livakovic eine Reihe scharfer Paraden für die Heimmannschaft erzielte und Spurs-Stürmer Harry Kane spät einen Kopfball von der Linie klärte, wurde Tottenham für einen Großteil des Spiels ausgespielt.
"Ich bin enttäuscht über die unterschiedliche Einstellung zwischen den einzelnen Teams", fügte Mourinho hinzu.
"Meine Mannschaft … hat nicht nur die Grundlagen des Fußballs ins Spiel gebracht, sondern ich glaube auch die Grundlagen des Lebens, nämlich unsere Jobs zu respektieren und alles zu geben."
Tottenham trifft am Sonntag in der Premier League auf Aston Villa, ein wichtiges Spiel für Mourinho, wenn seine Mannschaft um die Top-4-Platzierung kämpfen will.
Die englischen Rivalen von Spurs waren am Donnerstag in der Europa League erfolgreicher. Manchester United besiegte den AC Mailand im San Siro mit 1: 0 und sicherte sich einen 2: 1-Gesamtsieg sowie den Einzug ins Viertelfinale. Arsenal verlor 1: 0 gegen Olympiacos, erreichte aber auch die letzten acht mit einem 3: 2-Gesamtsieg.