Gegen Ende Spider-Man 2, Doktor Octopus tötet Peter Parker fast, indem er ein Auto auf ihn wirft, und während dies für jemanden, der versucht, Spider-Man durch Peter zu erreichen (ohne zu wissen, dass es sich um dieselbe Person handelt), wie ein verwirrender Schachzug erscheinen mag, war dies wahrscheinlich ein Teil von Octavius ‘ planen. Dr. Octopus braucht Tritium für seine experimentelle Energiequelle und konfrontiert Harry Osborn und droht, ihn zu töten, wenn er es nicht hergibt. Harry hat das Tritium wahrscheinlich nicht zur Hand und macht einen Deal mit dem verrückten Wissenschaftler: Er wird das Tritium im Austausch für einen lebendigen und unterworfenen Spider-Man erhalten. Octavius erfährt, dass Peter Parker Spider-Man für seine Arbeit fotografiert, und geht hinter Peter her und versucht, ihn bei seiner Suche nach Spider-Man zu töten.
Peter Parker kämpft derweil die ganze Zeit mit seinem Doppelleben Spider-Man 2, beschließt schließlich, seine kostümierte Persönlichkeit aufzugeben, als seine Kräfte zu versagen scheinen. Obwohl sich sein Leben für eine Weile wieder auf Kurs fühlt, ist er sich schmerzlich bewusst, was er als Spider-Man getan hat, also versucht er, seinen Heldenmut wieder aufzunehmen. Trotz aller Bemühungen scheinen seine Kräfte für immer verloren zu sein, bis Doktor Octopus ihn und Mary Jane Watson in einem Café angreift. Mit seinem und Mary Janes Leben in Gefahr tritt Peters außersinnliche Wahrnehmung, auch bekannt als sein Spinnensinn, ein und er bringt sich und Mary Jane aus dem Weg des Autos, das Doc Ock auf sie geworfen hat. Ohne Peters Kräfte wären die beiden getötet worden.
Doktor Octopus glaubte, dass Peter und Spider-Man zwei verschiedene Personen waren, wobei Peter eine persönliche Freundschaft mit dem maskierten Helden hatte und seine Heldentaten für eine Zeitung fotografierte. Vor diesem Hintergrund scheint es eine törichte Entscheidung zu sein, die einzige Person zu töten, die eine Verbindung zu Spider-Man hat, aber wenn man die Aktionen von Doctor Octopus in den Comics und im Rest von bedenkt Spider-Man 2, diese unnötig brutale Vorgehensweise macht Sinn. Doc Ock versuchte, Spider-Man herauszuziehen, indem er die eine Person tötete, von der er wusste, dass sie sich um Spider-Man kümmerte, und eine andere Person als Geisel nahm.
Nachdem er von Harry, Doc Ock, über die Verbindung von Peter und Spider-Man informiert wurde Spider-Man 2 Roman, zapfte Peter Parkers Telefon ab und erfuhr, dass er seine Freundin Mary Jane an einem bestimmten Ort und zu einer bestimmten Zeit treffen würde, und suchte ihn auf. Indem er ein Auto auf Peter warf, glaubte er, dass er Spider-Mans Freund und Fotografen töten würde, was den scheinbar abwesenden Helden dazu bringen würde, Doc Ock zu konfrontieren. Es ist ein schrecklich machiavellistischer Weg, um sein Ziel zu erreichen, der zu der Persönlichkeit von Doktor Octopus im Rest des Films und des Comic-Quellmaterials passt.
Wie der Rest der Szene beweist, hielt Doktor Octopus an diesem Plan fest, selbst nachdem Peter aus dem Weg gesprungen war. Doc Ock nimmt Mary Jane als Geisel als zusätzliche Motivation, Spider-Man in seine Falle zu locken, und sagt Peter, wo er auf Spider-Man warten wird, bevor er Peter gewaltsam gegen eine Wand wirft, wodurch er mit Trümmern bedeckt wird. Ohne seine Superkräfte hätte dies höchstwahrscheinlich auch Peter getötet, wenn auch nicht so schnell. Wären Peter und Spider-Man getrennte Menschen, hätte der maskierte Held seinen Freund im Café tödlich verletzt gefunden. Der sterbende Peter würde Spider-Man sagen, wo Doktor Octopus war und dass er Mary Jane als Geisel halten ließ, was den Helden motivierte, Octavius aufzusuchen.
Doctor Octopus ist sowohl in den Comics als auch in den Filmen einer der gefährlichsten und intelligentesten Feinde von Spider-Man. Alfred Molina blieb dem Quellenmaterial treu und porträtierte Doktor Octopus als ebenso brutal wie intelligent und erzeugte beim Wiederaufbau seines Tritium-betriebenen Geräts eine erschreckend große Zahl von Leichen. Einst ein guter Mann, wurde Octavius durch die eigensinnige künstliche Intelligenz in seinen prothetischen „intelligenten Armen“ grausam und gewalttätig, genauso wie sein komisches Gegenstück nach einem Hirnschaden bei einem Laborunfall größenwahnsinnig wurde. Aus diesem Grund war der Versuch von Doktor Octopus, Peter Parker zu töten, um Spider-Man herauszuziehen, eine entsprechend schreckliche Aktion in Spider-Man 2.